Алгоритм ИТМО ускорил поиск «двойных» антибиотиков против устойчивости

Исследователи Центра ИИ в химии Университета ИТМО представили алгоритм, который ускоряет отбор новых антибиотиков и снижает риск быстрой потери их эффективности из‑за мутаций бактерий. Работа опубликована в Journal of Chemical Information and Modeling.

Проблема стоит остро: по данным The Lancet, в 2019 году антибиотикорезистентность была связана почти с 5 млн смертей. Команда ИТМО предложила подход, при котором молекулы нацелены сразу на два ключевых бактериальных белка. Такой «двойной удар» усложняет формирование устойчивости: если один из белков мутирует, активность сохраняется за счёт воздействия на второй.

На базе алгоритма сгенерировали 56 кандидатов на основе бензимидазола против устойчивых штаммов E. coli. По результатам компьютерного моделирования два соединения превзошли референсный новобиоцин. Авторы подчёркивают, что это предварительные данные in silico, но они позволяют сосредоточить лабораторные ресурсы на наиболее перспективных молекулах и тем самым ускорить цикл разработки.

Аспирантка и соавтор работы Анастасия Орлова отметила, что обычно из десятков вычислительно отобранных структур в эксперименте подтверждаются единицы. Если эффективность новых соединений подтвердится в валидационных тестах, следующим шагом может стать патентование; команда ищет лабораторию для экспериментальных исследований.

Обратите внимание: С 1 октября пособия и пенсии начнут выплачивать в цифровых рублях. Как это объяснили