Генетики исследовали ДНК плейстоценовой семги
Американские и испанские ученые секвенировали древнюю ДНК из остатков семги, найденных в пещере Эль-Мирон — известном палеолитическом памятнике на Пиренейском полуострове. Геномное исследование показало, что лососи, жившие около 18 тысяч лет назад, были ближе к современным популяциям, обитающим в более северных регионах, чем Иберия. Митохондриальный анализ указал на то, что эффективный размер популяции самок данного вида в ледниковую эпоху был выше, чем у рыб, которые сегодня обитают в том же регионе. Об этом сообщается в статье, опубликованной в журнале iScience. Данную информацию сообщает портал N + 1.
Атлантический лосось (Salmo salar), или семга, — один из крупнейших представителей семейства лососевых. Он обитает в северной части Атлантического океана, а также в реках и некоторых северных озерах. Сегодня семга является важным объектом промысла и аквакультуры, что сделало ее первым генетически модифицированным животным, официально разрешенным к продаже и употреблению в пищу в Канаде и США.
Хотя атлантический лосось все еще распространен в естественной среде, его популяция значительно сократилась за последнее столетие из-за масштабного промысла и изменений среды обитания. Более того, на юге Европы субпопуляции семги оказались на грани исчезновения или вымерли. Пиренейский полуостров, в частности, когда-то мог быть одним из рефугиумов (климатических убежищ) для представителей этого вида в ледниковую эпоху. Известно, что уже тогда первобытные люди добывали эту рыбу и использовали ее образ в искусстве.
Даниэль Гарсия-Соуто из Института морских исследований в Виго и его коллеги из Испании и США, включая палеогенетика Дэвида Райха из Гарвардского университета, сосредоточили внимание на популяционной истории атлантического лосося. Для этого они проанализировали остатки рыб, найденные археологами в пещере Эль-Мирон — важном палеолитическом памятнике на севере Испании, где были обнаружены останки кроманьонцев ледникового периода, включая захоронение Красной леди из Эль-Мирона.
Ученые отобрали позвонки древних рыб, найденные в культурном слое, сформировавшемся между 18,8 и 16,7 тысячи лет назад — во времена существования мадленской культуры. Генетики секвенировали ДНК из восьми образцов и в семи случаях успешно реконструировали полные митохондриальные геномы этих особей, хотя и с низкой глубиной покрытия. Также были получены обрывочные сведения о ядерных геномах исследованных лососей.
Анализ митохондриальных геномов показал, что особи из Эль-Мирона по материнской линии ближе к лососям, обитающим в реках Великобритании и Франции, чем к рыбам из реки Асон, недалеко от которой находится пещера, где раскопали остатки древних особей. Судя по прочитанным однонуклеотидным полиморфизмам, плейстоценовые лососи с Пиренейского полуострова генетически ближе к северным популяциям семги, образцы которых происходили с Британских островов и из Норвегии. Ученые оценили эффективный размер популяции самок из Эль-Мирона — он составлял приблизительно 1548 особей. Для сравнения: у современных лососей из реки Асон он равняется около 731 особи, а из рек Рында и Танаэльв — примерно по 3000 особей.
С глубокой древности добычей лосося и другой рыбы занимались и доисторические жители Северной Америки. Например, не так давно ученые проанализировали материалы из археологических памятников на Аляске и обнаружили, что обитатели стоянок ловили налимов как минимум 13 тысяч лет назад, а лососей — не позднее 11,8 тысячи лет назад.
Больше новостей и эксклюзивных видео смотрите в канале Самара Онлайн 24 в MAX
