Алгоритм PRRDetect выносит приговор раку: слабые места опухоли под прицелом

Ученые из Кембриджа разработали алгоритм PRRDetect, способный выявлять опухоли с нарушениями восстановления ДНК. Этот инструмент анализирует полные геномные последовательности и помогает предсказать, какие опухоли лучше поддаются определённым видам терапии, включая иммунотерапию.

Алгоритм был протестирован на 4775 опухолях семи типов, используя данные проекта «100 000 геномов». Он распознаёт специфические паттерны «вставных» мутаций, характерные для опухолей с пострепликативной дисфункцией репарации (PRRd). Такие опухоли, как выяснилось, часто чувствительнее к иммунотерапии.

Разработка PRRDetect приближает онкогенетику к клинической практике, позволяя точно подбирать лечение и тем самым повышать шансы на выживание. Алгоритм также выявил 37 паттернов мутаций, включая 19 новых, не связанных ранее с известными механизмами развития рака.